Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ECM1Q16610 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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