Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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NR1I3Q14994 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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NR1I3Q14994 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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NR1I3Q14994 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
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NR1I3Q14994 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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NR1I3Q14994 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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NR1I3Q14994 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NR1I3Q14994 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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NR1I3Q14994 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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NR1I3Q14994 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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