Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GBX1Q14549 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms