Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms