Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MTMR3Q13615 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MTMR3Q13615 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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