Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CACNB1Q02641 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNB1Q02641 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNB1Q02641 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNB1Q02641 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNB1Q02641 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNB1Q02641 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNB1Q02641 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNB1Q02641 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNB1Q02641 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNB1Q02641 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNB1Q02641 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNB1Q02641 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNB1Q02641 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNB1Q02641 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNB1Q02641 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNB1Q02641 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNB1Q02641 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNB1Q02641 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNB1Q02641 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNB1Q02641 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNB1Q02641 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNB1Q02641 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 283.3 ms