Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LTBP3Q9NS15 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LTBP3Q9NS15 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LTBP3Q9NS15 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LTBP3Q9NS15 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LTBP3Q9NS15 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LTBP3Q9NS15 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LTBP3Q9NS15 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LTBP3Q9NS15 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LTBP3Q9NS15 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LTBP3Q9NS15 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
LTBP3Q9NS15 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LTBP3Q9NS15 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
LTBP3Q9NS15 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
LTBP3Q9NS15 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
LTBP3Q9NS15 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
LTBP3Q9NS15 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
LTBP3Q9NS15 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
LTBP3Q9NS15 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
LTBP3Q9NS15 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
LTBP3Q9NS15 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
LTBP3Q9NS15 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
LTBP3Q9NS15 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
LTBP3Q9NS15 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LTBP3Q9NS15 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.9 ms