Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ARHGEF4Q9NR80 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ARHGEF4Q9NR80 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ARHGEF4Q9NR80 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ARHGEF4Q9NR80 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ARHGEF4Q9NR80 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ARHGEF4Q9NR80 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ARHGEF4Q9NR80 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ARHGEF4Q9NR80 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ARHGEF4Q9NR80 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ARHGEF4Q9NR80 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ARHGEF4Q9NR80 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
ARHGEF4Q9NR80 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
ARHGEF4Q9NR80 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
ARHGEF4Q9NR80 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
ARHGEF4Q9NR80 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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