Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TPRNQ4KMQ1 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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