Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RTN1Q16799 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTN1Q16799 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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