Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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SGCAQ16586 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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SGCAQ16586 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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SGCAQ16586 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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SGCAQ16586 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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SGCAQ16586 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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SGCAQ16586 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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SGCAQ16586 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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SGCAQ16586 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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