Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CAPSQ13938 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 696.2 ms