Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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TUBA3CQ13748 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
TUBA3CQ13748 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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TUBA3CQ13748 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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TUBA3CQ13748 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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