Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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TOP3AQ13472 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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TOP3AQ13472 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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TOP3AQ13472 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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TOP3AQ13472 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TOP3AQ13472 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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