Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
AP3B2Q13367 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms