Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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