Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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USP18Q9UMW8 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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USP18Q9UMW8 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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USP18Q9UMW8 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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USP18Q9UMW8 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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USP18Q9UMW8 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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USP18Q9UMW8 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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USP18Q9UMW8 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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