Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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RABGEF1Q9UJ41 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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RABGEF1Q9UJ41 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
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RABGEF1Q9UJ41 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
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RABGEF1Q9UJ41 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
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RABGEF1Q9UJ41 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
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RABGEF1Q9UJ41 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1Q9UJ41 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
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