Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF3C6Q969F1 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms