Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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