Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKX1-1Q15270 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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