Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRRQ15256 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRRQ15256 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRRQ15256 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRRQ15256 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRRQ15256 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRRQ15256 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRRQ15256 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRRQ15256 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRRQ15256 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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PTPRRQ15256 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRRQ15256 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRRQ15256 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRRQ15256 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRRQ15256 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRRQ15256 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRRQ15256 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRRQ15256 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRRQ15256 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTPRRQ15256 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTPRRQ15256 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTPRRQ15256 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTPRRQ15256 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTPRRQ15256 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTPRRQ15256 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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PTPRRQ15256 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRRQ15256 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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