Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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