Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCINQ13939 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCINQ13939 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCINQ13939 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCINQ13939 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCINQ13939 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCINQ13939 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCINQ13939 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCINQ13939 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCINQ13939 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCINQ13939 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCINQ13939 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCINQ13939 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCINQ13939 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCINQ13939 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCINQ13939 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCINQ13939 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCINQ13939 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CCINQ13939 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CCINQ13939 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCINQ13939 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCINQ13939 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCINQ13939 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCINQ13939 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCINQ13939 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCINQ13939 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCINQ13939 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCINQ13939 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCINQ13939 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCINQ13939 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCINQ13939 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCINQ13939 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCINQ13939 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCINQ13939 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
CCINQ13939 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCINQ13939 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCINQ13939 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCINQ13939 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCINQ13939 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCINQ13939 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCINQ13939 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCINQ13939 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCINQ13939 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCINQ13939 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCINQ13939 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCINQ13939 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCINQ13939 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCINQ13939 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCINQ13939 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCINQ13939 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCINQ13939 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCINQ13939 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCINQ13939 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCINQ13939 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCINQ13939 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCINQ13939 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCINQ13939 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCINQ13939 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCINQ13939 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCINQ13939 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCINQ13939 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCINQ13939 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCINQ13939 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCINQ13939 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCINQ13939 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCINQ13939 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCINQ13939 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCINQ13939 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCINQ13939 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCINQ13939 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCINQ13939 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCINQ13939 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCINQ13939 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCINQ13939 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCINQ13939 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCINQ13939 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCINQ13939 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCINQ13939 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCINQ13939 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCINQ13939 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCINQ13939 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCINQ13939 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCINQ13939 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCINQ13939 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCINQ13939 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCINQ13939 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCINQ13939 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCINQ13939 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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