Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ALCAMQ13740 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms