Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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