Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC-1.47□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC-1.47□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.49□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.5□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPEQ02224 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms