Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VGFO15240 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VGFO15240 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VGFO15240 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VGFO15240 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VGFO15240 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VGFO15240 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VGFO15240 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VGFO15240 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VGFO15240 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VGFO15240 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VGFO15240 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VGFO15240 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VGFO15240 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VGFO15240 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VGFO15240 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VGFO15240 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VGFO15240 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VGFO15240 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VGFO15240 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VGFO15240 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VGFO15240 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VGFO15240 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VGFO15240 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VGFO15240 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VGFO15240 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VGFO15240 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VGFO15240 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VGFO15240 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VGFO15240 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VGFO15240 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VGFO15240 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VGFO15240 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VGFO15240 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
VGFO15240 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
VGFO15240 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
VGFO15240 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
VGFO15240 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
VGFO15240 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
VGFO15240 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
VGFO15240 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
VGFO15240 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
VGFO15240 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
VGFO15240 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
VGFO15240 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
VGFO15240 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
VGFO15240 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
VGFO15240 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
VGFO15240 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
VGFO15240 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
VGFO15240 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
VGFO15240 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
VGFO15240 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
VGFO15240 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
VGFO15240 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
VGFO15240 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
VGFO15240 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
VGFO15240 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
VGFO15240 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
VGFO15240 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
VGFO15240 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VGFO15240 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
VGFO15240 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VGFO15240 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VGFO15240 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VGFO15240 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VGFO15240 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VGFO15240 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VGFO15240 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VGFO15240 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VGFO15240 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VGFO15240 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VGFO15240 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
VGFO15240 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VGFO15240 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VGFO15240 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VGFO15240 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VGFO15240 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VGFO15240 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VGFO15240 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VGFO15240 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VGFO15240 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VGFO15240 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VGFO15240 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VGFO15240 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VGFO15240 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VGFO15240 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
VGFO15240 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VGFO15240 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VGFO15240 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VGFO15240 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VGFO15240 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VGFO15240 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VGFO15240 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VGFO15240 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VGFO15240 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VGFO15240 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VGFO15240 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VGFO15240 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VGFO15240 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms