Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP18Q9UMW8 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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