Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TMIEQ8NEW7 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMIEQ8NEW7 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147 ms