Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
OTOP3Q7RTS5 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC3□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC3□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC3□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC3□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC3□□□□□ -1.93
OTOP3Q7RTS5 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.6 ms