Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NLRC3Q7RTR2 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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