Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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HIF1AQ16665 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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