Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKN1Q16512 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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