Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDSNQ15517 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDSNQ15517 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDSNQ15517 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDSNQ15517 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDSNQ15517 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDSNQ15517 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDSNQ15517 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDSNQ15517 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDSNQ15517 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDSNQ15517 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDSNQ15517 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDSNQ15517 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDSNQ15517 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDSNQ15517 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDSNQ15517 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDSNQ15517 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDSNQ15517 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDSNQ15517 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDSNQ15517 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDSNQ15517 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDSNQ15517 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDSNQ15517 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDSNQ15517 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.3 ms