Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCINQ13939 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCINQ13939 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCINQ13939 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCINQ13939 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCINQ13939 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCINQ13939 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CCINQ13939 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCINQ13939 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCINQ13939 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCINQ13939 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCINQ13939 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCINQ13939 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCINQ13939 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCINQ13939 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCINQ13939 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCINQ13939 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCINQ13939 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCINQ13939 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCINQ13939 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CCINQ13939 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CCINQ13939 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCINQ13939 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCINQ13939 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCINQ13939 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCINQ13939 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCINQ13939 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCINQ13939 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCINQ13939 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCINQ13939 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCINQ13939 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCINQ13939 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCINQ13939 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCINQ13939 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCINQ13939 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCINQ13939 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCINQ13939 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCINQ13939 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCINQ13939 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCINQ13939 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCINQ13939 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCINQ13939 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCINQ13939 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCINQ13939 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCINQ13939 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCINQ13939 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCINQ13939 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCINQ13939 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCINQ13939 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCINQ13939 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCINQ13939 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCINQ13939 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCINQ13939 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCINQ13939 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCINQ13939 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCINQ13939 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCINQ13939 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCINQ13939 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCINQ13939 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCINQ13939 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCINQ13939 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCINQ13939 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCINQ13939 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCINQ13939 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCINQ13939 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCINQ13939 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCINQ13939 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCINQ13939 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCINQ13939 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCINQ13939 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms