Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
IRF5Q13568 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IRF5Q13568 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.7 ms