Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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TOP3AQ13472 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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TOP3AQ13472 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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TOP3AQ13472 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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TOP3AQ13472 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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TOP3AQ13472 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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TOP3AQ13472 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TOP3AQ13472 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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TOP3AQ13472 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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TOP3AQ13472 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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TOP3AQ13472 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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TOP3AQ13472 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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