Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SF3B2Q13435 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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