Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SP140Q13342 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SP140Q13342 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SP140Q13342 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SP140Q13342 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SP140Q13342 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SP140Q13342 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SP140Q13342 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SP140Q13342 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SP140Q13342 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SP140Q13342 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SP140Q13342 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SP140Q13342 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SP140Q13342 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SP140Q13342 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SP140Q13342 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SP140Q13342 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SP140Q13342 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SP140Q13342 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SP140Q13342 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SP140Q13342 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SP140Q13342 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SP140Q13342 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SP140Q13342 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SP140Q13342 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SP140Q13342 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SP140Q13342 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SP140Q13342 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SP140Q13342 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SP140Q13342 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SP140Q13342 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SP140Q13342 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SP140Q13342 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SP140Q13342 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SP140Q13342 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SP140Q13342 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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SP140Q13342 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SP140Q13342 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SP140Q13342 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SP140Q13342 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SP140Q13342 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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SP140Q13342 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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SP140Q13342 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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SP140Q13342 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SP140Q13342 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SP140Q13342 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SP140Q13342 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SP140Q13342 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SP140Q13342 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SP140Q13342 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SP140Q13342 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SP140Q13342 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SP140Q13342 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SP140Q13342 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SP140Q13342 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SP140Q13342 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SP140Q13342 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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