Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms