Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC-0.55□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.56□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC-0.59□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
PRDM2Q13029 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PRDM2Q13029 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PRDM2Q13029 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PRDM2Q13029 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PRDM2Q13029 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PRDM2Q13029 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PRDM2Q13029 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PRDM2Q13029 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PRDM2Q13029 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PRDM2Q13029 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PRDM2Q13029 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PRDM2Q13029 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
PRDM2Q13029 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PRDM2Q13029 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
PRDM2Q13029 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PRDM2Q13029 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PRDM2Q13029 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.6□□□□□ -2.51
PRDM2Q13029 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PRDM2Q13029 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PRDM2Q13029 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PRDM2Q13029 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
PRDM2Q13029 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PRDM2Q13029 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PRDM2Q13029 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PRDM2Q13029 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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