Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TTPAP49638 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TTPAP49638 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TTPAP49638 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TTPAP49638 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TTPAP49638 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TTPAP49638 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
TTPAP49638 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
TTPAP49638 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TTPAP49638 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TTPAP49638 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TTPAP49638 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TTPAP49638 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TTPAP49638 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
TTPAP49638 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TTPAP49638 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TTPAP49638 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TTPAP49638 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TTPAP49638 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TTPAP49638 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TTPAP49638 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TTPAP49638 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TTPAP49638 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TTPAP49638 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TTPAP49638 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TTPAP49638 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TTPAP49638 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TTPAP49638 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TTPAP49638 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
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TTPAP49638 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TTPAP49638 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
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TTPAP49638 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TTPAP49638 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TTPAP49638 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TTPAP49638 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
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TTPAP49638 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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TTPAP49638 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TTPAP49638 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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TTPAP49638 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
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TTPAP49638 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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TTPAP49638 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TTPAP49638 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TTPAP49638 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TTPAP49638 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TTPAP49638 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TTPAP49638 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TTPAP49638 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TTPAP49638 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TTPAP49638 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TTPAP49638 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TTPAP49638 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TTPAP49638 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TTPAP49638 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TTPAP49638 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TTPAP49638 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TTPAP49638 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TTPAP49638 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TTPAP49638 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TTPAP49638 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TTPAP49638 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TTPAP49638 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TTPAP49638 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TTPAP49638 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TTPAP49638 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
TTPAP49638 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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