Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PSDA5PKW4 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms