Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
CGGBP1Q9UFW8 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CGGBP1Q9UFW8 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
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