Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 LZTS1-204ENST00000616228 231 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC8A1-AS1-228ENST00000627210 225 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ORC1-202ENST00000371568 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1D-201ENST00000288139 9341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF7-208ENST00000426073 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 HBS1L-205ENST00000367837 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR7-202ENST00000357574 7213 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 NEMP1-202ENST00000379391 5370 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ZCCHC11-204ENST00000371544 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 RFX5-201ENST00000290524 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRL3-213ENST00000509896 5069 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF1B-205ENST00000377093 7565 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNE3-205ENST00000557275 13488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 PRRC2C-204ENST00000426496 10175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 DEFB124-201ENST00000317676 216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 AL139327.1-201ENST00000382988 348 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA7B-201ENST00000384360 139 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLJ2-201ENST00000390322 175 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 NUPR1-202ENST00000395641 550 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3137-201ENST00000577367 75 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL154P-201ENST00000578043 324 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 AC113349.2-201ENST00000607804 377 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ATXN3-203ENST00000393287 6770 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF169-201ENST00000340911 2336 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM135B-204ENST00000395297 6962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 LMO7-218ENST00000526202 4121 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 GAPVD1-207ENST00000394105 5207 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms