Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC-1.1□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
SMG1Q96Q15 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMG1Q96Q15 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
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