Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSMPQ1L6U9 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MSMPQ1L6U9 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms