Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

Predictions only

Length 1,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN21Q16825 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN21Q16825 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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