Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SGCBQ16585 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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